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11-302023
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野生和养殖丁肠道微生物菌群的比较分析
摘要:鱼类肠道菌群的结构和功能对其生长发育起重要作用。丁桂是我国新疆地区特有的经济养殖鱼类,为评估野生丁和养殖丁肠道微生物菌群的结构和差异,以野生丁和养殖丁作为研究对象,采用Illumina Miseq高通量测序方法对其肠道16S rRNA基因的V3~V4区进行测序,比较两种环境条件下丁肠道微生物菌群结构的丰度变化和差异。试验结果显示,丁肠道微生物的优势菌群主要为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门。但在两种环境下,其肠道菌群结构存在明显差异:在门水平下,梭菌门和酸菌门在养殖丁中的丰度显著低于野生丁(P<0.05);在属水平下,乳酸杆菌属和不动杆菌属在养殖丁中的丰度高于野生丁,而支原体和黄杆菌属则显著低于野生丁(P<0.01);在种水平下,洛菲不动杆菌在养殖丁中的含量显著高于野生丁(P<0.01),而未分类的黄杆菌则显著低于野生丁(P<0.05)。试验结果表明,由于饲养环境的改变,野生丁和养殖丁肠道菌群的组成及丰度出现显著变化。该结果可为后续丁肠道微生物的研究和养殖管理提供基础数据和参考。


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